冷冻电镜密度图可视化软件VAT4M
基于冷冻电镜三维密度图的特征分析,研究开发了冷冻电镜密度图可视化软件VAT4M(Visual Analysis Tools for Macro-Molecule Map and Model),实现了对三维冷冻电镜密度图的可视化分析,其主要功能包括密度图和分子模型的可视化、密度图的分割和晶体结构在密度图中的匹配.在可视化方面,在实现等值面可视化方法的同时还实现了体绘制可视化模式.对于结构分析,VAT4M提供了自动分割工具,和所见即所得的分割浏览器.同时,VAT4M还提供了极值吸收法与梯度法相结合的自动匹配方法,而且,对于具有对称性的密度图,可根据一个亚基的匹配结果,迅速得到其准原子模型.最后给出了若干应用实例.实验表明,本平台对冷冻电镜密度数据具有良好的可视与分析功能.
冷冻电镜、可视化、体绘制、分割、匹配
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TP319(计算技术、计算机技术)
创新工程项目;中国科学院知识创新工程重要方向项目;国家自然科学基金
2010-10-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
590-599,523,封面