随机森林方法预测膜蛋白类型

摘要：

膜蛋白的类型与其功能是密切相关的,因此膜蛋白类型的预测是研究其功能的重要手段,从蛋白质的氨基酸序列出发对膜蛋白的类型进行预测有重要意义.文章基于蛋白质的氨基酸序列,将组合离散增量和伪氨基酸组分信息共同作为预测参数,采用随机森林分类器,对8类膜蛋白进行了预测.在Jackknife检验下的预测精度为86.3%,独立检验的预测精度为93.8%,取得了好于前人的预测结果.

关键词：生物膜蛋白、随机森林法、离散增量、离散傅里叶谱、伪氨基酸组分

所属期刊栏目：25

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金;内蒙古自治区自然科学基金

在线出版日期：2010-01-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：349-355