使用估计的反应自由能预测组成性和可变剪接位点

摘要：

基因结构预测中的一个重要步骤是精确地识别剪接位点.基于剪接反应的基本物理原则,最大信息原理被应用到剪接反应的理论分析中,进而导出了反应自由能估计表达式.作为一个简化模型,这个表达式能被用来估计一个5'剪接区或者3'剪接区所参与的剪接反应中的自由能变化.它不但较全面地概括了各个碱基之间的关联,而且还考虑了基因组背景概率的影响.这个反应自由能表达式被用来预测了人类基因中的组成性和可变剪接位点,预测结果是令人满意的,其预测能力比得上当前的一些流行方法.这说明最大信息原理可以作为研究某些核酸-蛋白质相互作用系统(如剪接反应)的理论出发点,导出的反应自由能表达式较好地符合了剪接反应过程.

关键词：最大信息原理、剪接位点预测、反应自由能、可变剪接

所属期刊栏目：25

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2009-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：57-64