拟南芥和线虫基因序列及剪切位点的理论预测

摘要：

将拟南芥(A.thaliana)和线虫(C.elegans)基因组按外显子、内含子及基因间序列区分为3类.分别选取64、40、20种三联体的概率作为信号参数构建离散源,根据离散增量预测序列所属类型.结果表明:拟南芥各条染色体标准集总预测成功率达到82.19%,检验集为87.95%;线虫各条染色体标准集总预测成功率达到79.67%,检验集达到81.93%.另外,将两种基因序列中的外显子分别划分成3类,用外显子剪切位点、翻译起始和结束位点附近的三联体的3个位点作为3条子链,以各条子链的12个参数构建离散源,用离散增量对3种序列类型进行预测,预测成功率都达80%以上.

关键词：外显子、内含子、基因间序列、煎切位点、离散增量

所属期刊栏目：20

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金30160025

在线出版日期：2004-06-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：125-131