酵母、大肠杆菌和枯草杆菌基因组中短ORF的分布与形成原因

摘要：

用终止密码方法计算了酵母、大肠杆菌和枯草杆菌基因组中所有的第一类开阅读框架(记为理论ORF),给出了理论ORF和已知ORF随长度的分布,发现长度大于150个氨基酸后,理论ORF与已知ORF分布基本趋于一致,小于150个氨基酸的理论ORF数目的对数随长度线性变化,并提出这些短ORF是随机产生的猜想;研究了组分约束下的随机DNA序列中ORF数目、ORF的长度与随机序列总长度和GC含量之间的关系,证明了本文猜想的正确性;给出了短的理论ORF中可能的编码序列所占比例的分布曲线,这对识别短的编码序列有参考价值.

关键词：酵母、大肠杆菌、枯草杆菌、组分约束下的随机序列、开阅读框架分布

所属期刊栏目：18

分类号：Q615(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金10147204;内蒙古自然科学基金

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：307-312