利用支持向量机预测Ⅱ类MHC分子结合多肽

摘要：

抗原多肽序列与主要组织相容性复合体(MHC)分子的结合是引起T细胞免疫应答的先决条件.对结合多肽序列的预测可以大大减少实验所需的费用和时间.我们用支持向量机(SVM)对HLA DR4(B1*0401)编码的Ⅱ类MHC分子结合多肽进行了预测,将650个已知结合能力的多肽序列,按3:1的比例分成训练组和测试组进行训练和测试.对结合多肽,预测的准确率达到77.62%,对不结合多肽,准确率达到71.79%.这表明SVM方法鉴定用于免疫疗法的多肽片段是可行的.

关键词：主要组织相容性复合体(MHC)、人类白细胞抗原(HLA)、支持向量机(SVM)、预测

所属期刊栏目：17

分类号：Q617(理论生物物理学)

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：669-675