灵宝杜鹃bZIP家族全基因组鉴定及表达特征分析

摘要：

[目的]鉴定灵宝杜鹃(Rhododendron henanense subsp.lngbaoense)基因组的碱性亮氨酸拉链转录因子(basic leucine zipper,bZIP)家族成员,研究其非生物胁迫下的表达模式.[方法]鉴定RhlbZIP家族成员,构建系统发育树,进行基因结构、保守基序、顺势作用元件和表达模式分析.采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术,分析RhlbZIP基因在非生物胁迫中的表达.[结果]共鉴定出 57 个RhlbZIP基因,划分为 11 个亚家族,同一亚族成员有相似的结构和基序;不均匀地分布在 13 条染色体中,共线性分析发现共发生 45 次复制事件(3 对串联复制,42 对片段复制);顺式作用元件分析表明,RhlbZIP家族成员可能响应转录、发育、激素调控、生物与非生物胁迫等生物学过程;GO注释分析表明,RhlbZIP基因家族与转录调节、代谢、生物学过程等相关.转录组结果显示,87.72%的WRKY家族基因在根、茎、叶、花和下胚轴 5 种组织中均表达,但表达水平存在明显差异.RT-qPCR表达模式表明,RhlbZIP4低温处理下显著上调表达;RhlbZIP24在干旱和ABA处理下显著上调;RhlbZIP16在高盐和MeJA处理下显著上调.[结论]灵宝杜鹃基因组中共鉴定出 57 个RhlbZIP基因,所选的基因在不同处理下均有表达,其中低温、干旱、高盐、ABA与MeJA胁迫处理中的主效基因分别是RhlbZIP4、RhlbZIP24、RhlbZIP16、RhlbZIP24与RhlbZIP16.

关键词：灵宝杜鹃、bZIP基因家族、非生物胁迫、实时定量PCR

所属期刊栏目：40

分类号：S512.1;S651;Q94

资助基金：河南省高等学校重点科研项目;河南省自然科学基金项目;河南省大学生创新训练计划项目

在线出版日期：2024-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：186-198