急性髓系白血病mRNA与非编码RNA差异表达谱及CeRNA调控网络分析

摘要：

利用GEO数据库(gene expression omnibus database)通过生物信息学分析方法探讨急性髓系白血病(acute myelogenous leukemia,AML)的发病机制.检索GEO数据库中AML相关芯片数据集GSE142698、GSE142699和GSE96535.利用GEO2R分析得到差异mRNAs、miRNAs以及差异lncRNAs.利用在线生物信息学分析工具DAVID对差异mRNAs进行GO富集分析和KEGG通路分析.利用miRWalk数据库预测AML相关miRNAs的靶向mRNAs,利用Spongescan数据库预测AML相关miRNAs的靶向lncRNAs,构建lncRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络.共筛选出29个显著差异mRNAs、70个显著差异miRNAs和20005个显著差异lncRNAs.GO富集分析和KEGG通路分析显示,差异表达基因主要涉及蛋白磷酸化、细胞分裂、细胞增殖的负调控、基因表达的正向调节、周期蛋白依赖的丝氨酸/苏氨酸激酶活性的调节等生物过程以及细胞周期、细胞衰老、癌症通路、PI3K-Akt通路等信号通路.将miRWalk数据库预测的靶向mRNAs与差异mRNAs取交集,Spongescan数据库预测的靶向lncRNAs与差异lncRNAs取交集,分别确定了25个mRNAs、6个lncRNAs参与AML相关ceRNA调控网络的构建.结果表明,lncRNAs可能作为关键的ceRNA,通过调控miRNA和相关靶基因参与AML的发生与发展,研究结果为AML诊断和治疗的分子生物学研究提供了新的依据.

关键词：急性髓系白血病、非编码RNA、竞争性内源RNA网络

所属期刊栏目：13

分类号：R733(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金82104609

在线出版日期：2023-02-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：146-153