不同预处理对小鼠粪样菌群高通量测序分析结果的影响

摘要：

应用高通量测序技术比较不同预处理对小鼠粪样菌群结构的影响,以期为后续相关研究提供参考依据.采集昆明小鼠新鲜粪样,分为原始粪样组、生理盐水处理组和PBS处理组,提取粪样DNA,采用Illumina MiSeq平台进行测序对3组样本的16S rRNA V3～V4区基因文库进行生物信息学分析.结果显示,3组样本拥有共同的OTUs 188个,不同预处理对粪样微生物多样性和丰度产生影响,生理盐水处理组、PBS处理组和原始粪样组分别检出14、11、12个门,3组样本共有门11个;分别检出24、21、21个纲,3组样本共有纲20个;分别检出62、55、59个科,3组样本共有科26个;分别检出147、126、137个属,3组样本共有属117个.总体来看,生理盐水处理组微生物多样性和丰度相对最高,原始粪样组次之,PBS处理组最低.粪样经生理盐水处理后,能在一定程度上提高肠道菌群检测的准确性.

关键词：高通量测序、生理盐水、PBS缓冲液、粪样菌群

所属期刊栏目：13

分类号：R965(药理学)

资助基金：山西省自然科学基金面上项目;山西省现代农业产业技术体系建设专项;山西中医药大学科技创新科学团队项目;山西中医药大学科技创新培育计划项目

在线出版日期：2023-02-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：115-123