利用生物信息学方法解析自噬相关基因在人体红细胞终末分化各阶段的动态表达

摘要：

为了探究自噬相关基因在人体红细胞终末分化各阶段的表达概况,利用生物信息学方法对人体终末分化各阶段红细胞转录组测序(RNA sequencing,RNA-Seq)数据中自噬相关基因的表达进行提取并分析.结果表明,自噬相关基因在红细胞终末分化各阶段呈现不同的表达模式;在红细胞终末分化的早期,超过50％的自噬相关基因呈现高表达状态;原始红细胞及早幼红细胞中高表达的自噬相关基因富集的生物学过程主要包括细胞自噬及其调节、蛋白质的磷酸化及囊泡的运输,而线粒体自噬相关基因主要在中幼红细胞及晚幼红细胞阶段高表达.研究发现,自噬相关基因在人体红细胞终末分化各阶段的表达呈现动态变化;不同阶段的红细胞中高表达的自噬相关基因及其富集的生物学过程均不同.

关键词：自噬相关基因、红细胞终末分化、RNA-Seq、红细胞成熟、生物信息学分析

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资助基金：国家自然科学基金项目81870089;国家重点研发计划项目2016YFA0102300,2017YFA0103100;中央高校基本科研业务费专项资金3332018157;中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目2016-I2M-1-018,2016-I2M-3-002,2017-I2M-1-015

在线出版日期：2019-06-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：271-276