基于生物信息学和分子对接筛选结直肠腺癌的潜在生物标志物及其靶向药物

摘要：

[目的]获取结直肠癌(Colon adenocarcinoma,COAD)的潜在生物标志物及其靶向药物.[方法]用R和Cytoscape 3.8.2软件分析临床数据库中56例COAD患者和45例正常样本的转录组数据,获取生物标志物及其共表达基因并分析其生物功能.通过miRWalk和miRTarBase数据库得到与COAD生存预后相关的miRNAs并分析它们的功能.利用分子对接筛选与所获生物标志物具有较好结合能力的靶向中药小分子化合物.[结果]共筛选得到179个差异表达基因,包括49个高表达基因和130个低表达基因.STRING和Cytoscape 3.8.2所得30个Hubba基因中仅CLCA1符合Cox模型(C-index:0.708(0.632-1),P＜0.001).CLCA1及其共表达基因主要参与氯离子跨膜转运过程,与肿瘤的发生发展密切相关(P＜0.01).mRNA-miRNA网络中与CLCA1密切相关的10个miRNA主要参与肿瘤细胞的增殖,凋亡和血管的形成.且甘草次酸、小檗碱和雷公藤红素被证实与CLCA1结合较牢.[结论]CLCA1是COAD的潜在生物标志物,且甘草次酸、小檗碱和雷公藤红素是CLCA1的潜在靶向药物.

关键词：生物信息学、结直肠腺癌、预后生物标志物、分子对接、靶向药物

所属期刊栏目：33

分类号：R735.3+5(肿瘤学)

资助基金：武汉中青年医学骨干人才项目

在线出版日期：2023-05-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：176-186