骨膜蛋白(POSTN)在肺鳞癌中的表达及临床意义分析

摘要：

[目的]通过多种生物信息学手段分析骨膜蛋白POSTN在肺鳞癌(Lung squamous cell carcinoma,LUSC)中的表达、临床意义及可能机制.[方法]①通过cbioportal数据库分析POSTN在不同肿瘤组织中的表达情况.②通过GSE数据集分析POSTN在不同非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达差异.③通过Oncomine数据库分析POSTN在LUSC组织中的表达情况.④通过GEPIA数据库分析POSTN在LUSC组织中的表达及与患者预后之间的关系.⑤通过MethHC数据库分析POSTN在LUSC中的甲基化水平.⑥通过STRING数据库分析POSTON相互作用蛋白及其在细胞信号传导通路中的位置.⑦通过LinkedOmics进行POSTN表达相关性和KEGG富集分析.[结果]①cbioportal数据库分析显示LUSC中POSTN表达水平位居各类肿瘤组织第四位.②GSE数据集分析显示LUSC 细胞系中 POSTN 表达水平高于小细胞肺癌(small cell lung carcinoma,SCLC)、肺腺癌(Lung adenocarcinoma,LU-AD),但差异无统计学意义(P=0.637;P=0.209).③Oncomine数据库分析显示POSTN基因在所有入选LUSC数据集中都表达均有所上调,与正常组织相比表达差异具有统计学意义(P=5.50E-5).④GEPIA数据库显示POSTN在LUSC肿瘤组织中高表达,差异具有统计学意义(P＜0.01),高表达LUSC患者总生存期(overall survival,OS)较低表达患者缩短,差异具有统计学意义(P=0.012).⑤STRING数据库显示CDH11、COL1 A1、COL1A2、COL3A1、COL5A2、DCN、FN1、IL13、LUM、MMP2与POSTN有明显相互作用.⑥LinkedOmics数据库分析POSTN可能参与LUSC的细胞粘附过程.[结论]LUSC组织中POSTN基因在mRNA转录水平上远高于正常肺组织,其原因可能是LUSC组织中POSTN基因S_Shore区的甲基化水平较低.与POSTN低表达相比,高表达的LUSC患者OS明显降低.POSTN可能通过调控细胞粘附过程参与LUSC的进程.

关键词：肺鳞癌;POSTN;生物信息学分析;甲基化;细胞粘附

所属期刊栏目：31

分类号：R734(肿瘤学)

资助基金：江苏省自然科学基金项目;江苏省科技发展项目

在线出版日期：2021-09-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：344-351,320