10.16519/j.cnki.1004-311x.2021.02.0023
miRNA-143-3P在组织中的表达及其靶基因预测与功能分析
[目的]探究miRNA-143-3P在从江香猪与杂交猪之间是否存在表达水平的差异性,预测分析该miRNA的靶基因及其功能,分析miR-143-3P在这两个猪种中的功能.[方法]通过RT-qPCR检测从江香猪与杂交猪中不同组织的miRNA-143-3P,利用线软件预测miRNA-143-3P的靶基因,对筛选的靶基因作生物信息学分析,了解miRNA-143靶基因的功能.[结果]荧光定量PCR检测的结果显示,在从江香猪中的表达量最高的是肝脏,而杂交猪的是脾脏,存在表达差异极显著的组织有肺、大肠、小肠、脾、肝(P<0.01).软件预测靶基因时,共存的有30个.生物功能分析时发现,这些基因多数存在于细胞质(53.6%)和细胞核(46.4%)中,而在蛋白质结构域是在跨膜区和螺旋区占多数,分别占26.9%、23.1%,而在与转录因子结合较多的是SP1(71.4%),组织表达较高的为肺、肝、肾,高达80%,而热图显示RA4B7A、LASP1、MYO6、KRAS这四个基因在数据库中的富集相对较广.[结论]miRNA-143-3P在从江香猪与杂交猪之间存在表达性差异,这种差异与该miRNA-143-3P所对应的靶基因功能相关.
香猪、组织表达、靶基因预测、生物功能
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Q784(基因工程(遗传工程))
国家科技支撑计划;国家科技攻关计划
2021-05-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共7页
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