从江香猪TPM3基因的克隆与序列分析

摘要：

[目的]对从江香猪TPM3基因进行扩增、克隆和序列分析.[方法]通过RT-PCR从猪背最长肌中扩增TPM3基因CDS区并进行克隆,利用DNAMAN和BioEdit等软件对克隆的序列进行分析.[结果]成功克隆了从江香猪TPM3基因并构建了pUCm-T-TPM3载体;获得了TPM3-1和TPM3-2两个序列,TPM3-1有两个碱基的差异,相似度达99.73％;TPM3-2有一个碱基的变化,同时插入了一段76 bp的片段,相似度达99.87％;密码子偏好性分析显示,UUG编码亮氨酸的频率为0.49％,而CUG编码亮氨酸的频率为2.89％,说明第49位碱基的转换可能提高蛋白的合成效率;RNA二级结构分析显示,碱基突变会影响TPM3基因RNA二级结构和最小自由能的变化;蛋白理化性质分析显示,氨基酸的改变对α螺旋、β折叠及转角等二级结构影响不明显.[结论]从江香猪TPM3基因的碱基突变可能影响原肌球蛋白的合成,为探究其对从江香猪肉质及种资源的开发利用提供试验依据.

关键词：从江香猪、TPM3基因、克隆、序列分析

所属期刊栏目：28

分类号：Q953(动物学)

资助基金：国家科技支撑计划;黔科合重大专项

在线出版日期：2018-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：307-312