人线粒体转录延伸因子蛋白结构与功能的生物信息学分析

摘要：

[目的]基于生物信息学方法分析人线粒体转录延伸因子TEFM蛋白的结构和功能.[方法]检索Uniprot数据库中人线粒体转录终止因子TEFM蛋白的氨基酸序列,利用生物信息学方法对人TEFM的理化性质、物种间的蛋白质同源性、跨膜区、亲水性/疏水性、亚细胞定位、蛋白质二级结构、保守结构域、蛋白质三级结构、蛋白质相互作用进行预测与分析.[结果]人TEFM全长360个氨基酸,理论等电点9.39,属于TEFM蛋白超家族,不含跨膜区,属于亲水蛋白;人TEFM含有一个保守的螺旋-发夹-螺旋(HHH_3)结构域,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维建模空间结构与二级结构预测结果相符,进一步分析建模结果可靠.与人TEFM相互作用的蛋白质均为线粒体DNA转录因子或线粒体RNA聚合酶.[结论]人TEFM具有线粒体转录延伸因子蛋白超家族的典型结构,生物信息学分析结果对深入研究人TEFM在线粒体基因转录调控中的作用具有一定的理论指导意义.

关键词：人、线粒体转录延伸因子、生物信息学、结构与功能

所属期刊栏目：25

分类号：Q811.4(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金;云南省教育厅科研重点项目;大理大学博士科研启动基金;大理大学大学生创新创业训练计划

在线出版日期：2015-11-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：474-480