溶藻弧菌耐药基因qnr的克隆及生物信息学分析

摘要：

[目的]克隆溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)喹诺酮类耐药基因qnr并分析其蛋白结构,为研究该蛋白的生物学功能奠定基础.[方法]根据NCBI上公布的相关序列设计qnr基因特异性引物,利用PCR方法扩增基因序列,进行DNA测序及生物信息学分析.[结果]从溶藻弧菌染色体上获得qnr基因大小为651 bp,编码216个氨基酸,进化分析可知其与副溶血弧菌有很近的亲缘关系,二级结构分析含有五肽重复序列,三维结构与大肠杆菌质粒上的qnr蛋白空间结构极为相似.[结论]通过对蛋白质序列分析和结构预测,初步确定该基因为喹诺酮耐药基因,为水产细菌的耐药机制研究奠定基础.

关键词：溶藻弧菌、喹诺酮、耐药基因、五肽重复序列、生物信息学

所属期刊栏目：25

分类号：Q785(基因工程（遗传工程）)

资助基金：农业部行业专项;广东省教育厅高等学校高层次人才项目

在线出版日期：2015-11-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：414-419