Kunitz蛋白酶抑制剂基因的密码子偏好性分析

摘要：

目的:分析豆科植物的Kunitz蛋白酶抑制剂(KTI)基因密码子偏好性,确定最适模式植物与外源表达系统.方法:运用Codon W等程序分析密码子偏好性,并用决明KTI基因验证分析结果的可信度.通过聚类分析,确定研究KTI基因功能的最适模式植物,比较决明KTI基因与酵母和大肠杆菌的基因组密码子偏好性,选择最优外源表达系统.结果:KTI基因对以A或U结尾的密码子偏好性强.豆科与茄科植物聚为一簇,表明烟草是研究KTI基因功能的最适模式植物.决明KTI基因和大肠杆菌、酵母基因组对比,有较大密码子使用频率差异的各有28、24个,表明酵母是最优外源表达系统.结论:确定研究KTI基因功能的最佳模式植物是烟草,酵母是最优外源表达系统,对基因改良与育种具有指导意义.

关键词：密码子偏好性、Kunitz型蛋白酶抑制剂、聚类分析、外源表达

所属期刊栏目：24

分类号：Q782;Q786(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金项目“NAC特异基因调控铁皮石斛原球茎原分生组织形成的分子机理研究”,No.31271302;西南交通大学个性化实验GX201309180资助

在线出版日期：2014-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：39-44