拟南芥AtTPS1基因的生物信息学分析与功能预测

摘要：

目的:对AtTPS1基因及其编码产物的结构、表达定位、分子进化、蛋白互作等进行预测和分析.方法:利用在线网络生物信息学相关数据库和分析软件对目的蛋白的同源性、保守结构域、疏水性、跨膜区进行分析;并对基因的表达情况、蛋白质的亚细胞定位、蛋白质间的相互作用进行预测.结果:AtTPS1表现出较强的亲水性,在多肽链的内部可能存在跨膜结构和保守结构域.在拟南芥的不同组织和器官都可检测到AtTPS1基因的表达,尤其在茎顶端分生组织、种子和花中表达强烈.AtTPS1在叶绿体中分布最为广泛,其次是线粒体和细胞核.至少有四类蛋白与AtTPS1之间存在较为强烈的相互作用.结论:生物信息学分析结果表明,AtTPS1功能复杂,很可能在细胞分裂、胚胎和花发育、种子萌发、光合作用、物质代谢等过程中充当重要的角色.

关键词：生物信息学、拟南芥、AtTPS1基因、海藻糖、胁迫

所属期刊栏目：24

分类号：Q786(基因工程（遗传工程）)

资助基金：山东省自然科学基金;滨州学院博士基金

在线出版日期：2014-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：34-39