聚球藻Synechococcus sp.PCC7336基因组结构解析

摘要：

目的:对新测序菌株Synechococcus sp.PCC 7336的基因组结构分析.方法:利用多种生物信息学工具进行基本信息分析.构建本地比对数据库进行多序列比对分析.构建本地注释数据库进行基因、蛋白质功能分析.基于16S rRNA构建进化树对不同菌株进行聚类并分析进化差异.结果:GC含量为53.7％,共有5 096个蛋白质编码基因,47个RNA基因和不同类型的重复回文序列.与光合作用相关的基因分为9大类,信号传导以“双组分调控系统”为代表,11个次级代谢基因簇合成生物活性物质.进化分析显示其与传统聚球藻菌株差异较大,而与无类囊体蓝藻亲缘关系更密切.结论:Synechococcus sp.PCC 7336是聚球藻属中一个特殊的菌株,在基因组结构、基因数量、进化历程等方面都与其他菌株存在较大差异.

关键词：聚球藻、基因组、光合作用、信号传导、调控、进化

所属期刊栏目：24

分类号：Q933(微生物学)

资助基金：国家自然科学基金项目“房颤的致病分子调控路径及其亚型的量化分类方法研究”,No.81171411资助

在线出版日期：2014-09-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：46-51