贵州山羊品种DQA1基因第3外显子遗传变异分析

摘要：

目的:通过筛选3个贵州地方山羊种DQA1基因Exon3的SNPs位点并做相应的遗传变异分析,为今后山羊抗病育种及地方山羊品种的选育提供理论依据.方法:采用构建品种DNA池与直接测序的方法,对三个贵州地方山羊种群共514只个体的DQA1基因外显子3进行遗传变异分析.结果:在3个山羊品种中共筛选得到4个SNPs,G71A(同义突变)、T100C (Asn-→ Ser)、G202A (Pro→Leu)、A223G(Met→Thr).生物信息学分析发现,G202A位点变异虽未引起mRNA二级结构的变化,但最小自由能降低,结构稳定性增强;DQA1基因Exon3的不同基因型的蛋白质二级结构中均不含有α螺旋.结论:三个贵州地方山羊种DQA1基因外显子3中含有较丰富的多态性,G202A位点变异在mRNA二级结构及蛋白质二级结构中与其他基因型具有较明显的差异.

关键词：贵州山羊品种、DQA1基因、SNPs、生物信息学

所属期刊栏目：24

分类号：Q751;S827(分子遗传学)

资助基金：贵州省农业科技攻关项目“贵州白山羊品系繁育及其杂交配套系关键技术研究与示范”,编号:黔科合NY字”2012” 3006号资助

在线出版日期：2014-09-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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