基于IBS算法预测亲缘关系准确性研究
目的 评估基于状态一致性(identity-by-state,IBS)算法预测个体间亲缘关系的准确性.方法 采用Illumina GSA芯片对253份样本进行全基因组检测,基于高密度单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)数据计算两两个体间IBS共享统计量预测亲缘关系.通过不同条件参数筛选SNP,评估位点数对算法预测准确性的影响.结果 1～4级亲缘关系预测准确率高达99％,预测误差在1级以内且无假阳性.SNP数量减少对预测准确率无显著影响,即使在较低密度的SNP标记中,该算法也能获得较高的准确率.结论 IBS算法是法医系谱推断的有效方法,且对于微量降解的法医现场检材具有很好的应用价值.
IBS算法、单核苷酸多态性、状态一致性、亲缘关系等级、法医遗传学、法医系谱推断
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R89;Q812(法医学)
国家科技资源共享服务平台计划;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;陕西省重点研发计划资助课题;公安部 “双十计划”重点攻关任务项目;首都科研领军人才培养工程资助
2022-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
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