肺鳞状细胞癌特异性甲基化候选诊断标志物的识别

摘要：

甲基化异常是肿瘤早期的频发事件,DNA甲基化随着时间的推移相对稳定,并且可以在血液中非侵入性地检测到,因此DNA甲基化具有成为癌症早期诊断生物标志物的巨大潜力.为了找到肺鳞状细胞癌(LUSC)潜在的诊断标志物,本文提出了一种LUSC特异性候选诊断标志物的识别方法,使用癌症基因组图谱数据库(TCGA)的LUSC的甲基化数据集,通过比较LUSC与正常肺组织和其他癌症类型,得到了6个LUSC特异性甲基化位点,使用支持向量机建立诊断模型,采用六折交叉划分数据集,验证特异性标志物的有效性.6个标志物的组合在预测LUSC方面达到约93％～99％的灵敏度,在排除正常组织时达到100％的特异性,在排除其他癌症时达到约99％的特异性.我们的研究为LUSC的早期诊断提供了潜在的生物标志物.

关键词：DNA甲基化、特异性标志物、肺鳞状细胞癌、早期诊断

所属期刊栏目：46

分类号：Q7;Q8

资助基金：重点研发计划;国家自然科学基金;国家国际科技合作专项基金

在线出版日期：2019-08-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：680-688