基于毛干蛋白质组的族群推断技术的建立与验证
毛干是一种案件现场常见的生物物证,由于核DNA含量极少且高度降解,难以采用现有的短串联重复序列(short tandem repeat,STR)检验方法进行个人识别鉴定,目前仅使用线粒体DNA检验进行母系亲缘关系的判定,利用率非常低.毛干中蛋白质非常稳定,而且具有遗传多态性,表现为基因组中的非同义单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,ns SNPs),转录翻译后形成蛋白质序列中的单氨基酸多态性(single amino acid polymorphisms,SAPs).充分利用毛干蛋白质中蕴含的遗传信息,为案件提供线索和证据,是实际公安业务的迫切需求,具有重要的应用价值.本文选取了104份中国汉族的毛干样本进行蛋白质组的检测,共获得了703个SAP位点,位于460个蛋白质上,共推导出552个nsSNP位点.进一步筛选在所有样本中检出率超过15％的位点,获得了88个nsSNP位点,使用毛干样本对应的口腔拭子DNA对88个nsSNP位点进行一代测序验证.为评估发现的nsSNP位点对于人群的区分能力,以千人数据库(1 000 Genome Project)为参考数据库,采用聚类分析和群体匹配概率等方法对检测的19份毛干样本进行人群来源推断.结果显示,通过检测毛干蛋白质组中的nsSNP可以实现东亚、欧洲、非洲三大洲际人群的区分.
毛干蛋白质组、单氨基酸多态性、非同义单核苷酸多态性、祖先来源推断
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Q-3(生物科学的研究方法与技术)
国家自然科学基金;国家重点研发计划;基本科研业务费项目;首都科技领军人才培养工程资助项目
2019-03-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
81-88
