融合位置特征与序列进化信息的磷酸化位点预测

摘要：

磷酸化是蛋白质翻译后的主要修饰,可分为激酶特异性和非激酶特异性两种类型.以非激酶特异性磷酸化位点Dou数据集为基础,本文发展了一种基于位置的卡方差表特征x2-pos,融合伪氨基酸序列进化信息PsePSSM表征序列,构建正负样本均衡的支持向量机分类器,S,T,Y独立测试Matthew相关系数、ROC曲线下面积分及准确率分别达到了(0.59、0.87、79.74％),(0.55、0.85、77.68％)和(0.50、0.81、75.22％),明显优于文献报道结果.x2-pos、PsePSSM两种特征的融合在蛋白质磷酸化位点预测中有广泛应用前景.

关键词：磷酸化、预测、卡方差表特征、伪氨基酸序列进化信息、支持向量机

所属期刊栏目：44

分类号：TP391.41;Q61;G841

在线出版日期：2018-01-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1118-1124