C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列预测方法的研究进展
C2H2型锌指蛋白是哺乳动物中数量最多的一类转录调控因子.C2H2型锌指蛋白中含有的C2H2型锌指基序多是不相同的,表明它们很可能结合不同的DNA序列,从而调控不同的基因,行使多样化的调控功能.然而,目前大多数C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列仍不明确,这阻碍了C2H2型锌指蛋白的功能研究.目前,针对C2H2型锌指蛋白的靶序列预测已有一些初步的研究.本文介绍了C2H2型锌指基序与DNA结合的经典模式,并对C2H2型锌指蛋白靶序列预测方法中所用到的算法、训练集、金标准数据集及相应工具进行了全面系统的总结归纳,旨在丰富对C2H2型锌指蛋白靶序列预测原理和工具的认识,为C2H2型锌指蛋白靶序列的精确预测和更深入的功能研究打下基础.
转录因子、C2H2型锌指蛋白、靶序列预测
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R9 ;R31
国家自然科学基金31671376;北京市科技新星计划Z161100004916148;国家国际科技合作专项2014DFB30020,2014DFB30010;国家重大科学研究计划2015CB910700,2014CBA02001;蛋白质组学国家重点实验室开放课题SKLP-O201404,SKLP-O201507资助项目.This work was supported by grants from The National Natural Science Foundation of China31671376;the Beijing Nova ProgramZ161100004916148;the International Science & Technology Cooperation Program of China2014DFB30020,2014DFB30010;the National Major Scientific Research Program2015CB910700,2014CBA02001;the Foundation of State Key Lab of ProteomicsSKLP-O201404,SKLP-O201507
2017-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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573-579
