染色质免疫沉淀-测序:全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术

摘要：

染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术.在新一代测序(NGS)技术的大力推动下,ChIP-seq提供了一种相对于ChIP-chip高分辨率、低噪音、高覆盖率的研究方法.随着测序成本的降低,ChIP-seq逐步成为研究基因调控和表观遗传机制的一种常用手段.本文就该技术的最近研究进展进行综述,并着重介绍ChIP-seq数据分析过程及该技术的实际应用情况.

关键词：ChIP-seq、新一代测序技术、基因调控、表观遗传学、数据分析

所属期刊栏目：40

分类号：Q78;Q81(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81272298,30871282,30871365,81172189,81171930;湖南省自然科学基金10JJ7003;霍英东高校青年教师基金121036;中央高校基本科研业务费专项资金2011JQ020;中南大学米塔尔创新创业项目11MX27;中南大学贵重仪器设备开放共享基金

在线出版日期：2013-05-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：216-227