新一代高通量RNA测序数据的处理与分析

摘要：

随着新一代高通量DNA测序技术的快速发展,RNA测序(RNA-seq)已成为基因表达和转录组分析新的重要手段.RNA-seq技术产生的海量数据为生物信息学带来了新的机遇和挑战.有效地对测序数据进行针对性的生物信息学处理和分析,成为RNA-seq技术能否在科学探索中发挥重大作用的关键.以新一代Illumina/Solexa测序平台所产生的数据为例,在扼要介绍高通量RNA-seq测序流程的基础上,对RNA-seq数据处理和分析的方法和现有软件做一个较为全面的综述,并对其中有待进一步研究的问题进行展望.

关键词：高通量RNA测序、转录组、基因表达、数据处理与分析、生物信息学

所属期刊栏目：37

分类号：Q5;Q6;Q7

资助基金：国家自然科学基金;东南大学生物电子学国家重点实验室开放研究项目

在线出版日期：2010-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：834-846