PNmerger:一个整合生物学通路和蛋白质相互作用网络的Cytoscape插件
Cytoscape是一个广泛应用于分子相互作用网络可视化的软件.发展了一个基于java的Cytoscape插件PNmorger.对于一个蛋白质相互作用网络,PNmerger能够使用KEGG数据库中的通路信息自动注释网络中的蛋白质.并通过网络和通路的比较发现网络中已知的通路元件,预测可能的通路元件及通路交联元件.该软件可以可视化网络中存在的通路模块,并将连接不同通路间的潜在交联元件显示出来.PNmerger软件能够有效地帮助实验人员发现网络中重要的功能线索,帮助实验人员进行实验设计.用户可以通过网站http://www.hupo.org.cn/PNmcrger下载PNmerger插件.
系统生物学、生物学通路、蛋白质、蛋白质相互作用、交联元件、通路扩展、cytoscape插件
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Q61(理论生物物理学)
国家重点基础研究发展计划973资助项目2006CB910803,2006CB910706;国家高技术研究发展计划863资助项目2006AA02A312;国家科技重大专项2008ZX10002-016,2009ZX09301-002;国家自然科学基金30621063,30800200;蛋白质组学国家重点实验室课题SKLP-Y200811资助项目. This work was supported by grants from National Basic Research Program of China2006CB910803, 2006CB910706;Hi-Tech Research and Development Program of China2006AA02A312;National S&T Major Project2008ZX10002-016, 2009ZX09301-002;The National Natural Science Foundation of China30621063, 30800200;State Key Laboratory of ProteomicsSKLP-Y200811
2010-03-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共4页
1613-1616
