HIV-1整合酶核心区野生型和F185K突变型活性和溶解性的比较及分子动力学模拟分析

摘要：

表达纯化了野生型(WT)及F185K突变型HIV-1整合酶核心区蛋白(INc),并对二者的溶解性和活性进行了比较.实验结果表明:F185K突变后INc溶解性显著提高,活性有一定程度降低.对WT和F185K INc体系进行了1800 ps的分子动力学模拟.模拟结果表明:F185K INc功能loop区柔性和蛋白质整体运动性降低,使蛋白质活性降低,F185K突变后盐桥网络的变化驱动了INc局部构象改变,引起INc表面的部分疏水残基被包埋,亲水残基暴露,相对亲水溶剂可接近面积增大,同时,突变后INc与水之问形成氢键的数量增加,与水之间作用加强,以上变化使INc溶解性提高.分子动力学模拟与实验结果相吻合.为理解蛋白质溶解性和对蛋白质进行可溶性改造提供了一定的理论依据.

关键词：HIV-1整合酶、活性、溶解性、分子动力学模拟

所属期刊栏目：36

分类号：O641;Q7(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金30670497;北京市自然科学基金5072002

在线出版日期：2009-11-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1146-1153