人类基因组中可变和组成性剪接位点的预测

摘要：

根据剪接位点的核酸序列保守特征,以及邻近位点的碱基组成和关联特性,结合一对可变剪接位点之问的距离参数和受体端剪接位点前30位碱基的GC和TC含量,利用结合多样性指标的二次判别方法(IDQD),预测了人类基因组中可变和组成性内含子的供体端和受体端的剪接位点,对可变的供体端和受体端剪接位点,阈值ξ选择-2时,总的预测精度分别为87.9%和89.9%,对组成性的供体端和受体端剪接位点,阈值ξ选择-1,总的预测精度分别为92.8%和94.3%.

关键词：可变剪接、组成性剪接、二次判别方法

所属期刊栏目：35

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金资助项日10447003,90403010;内蒙古自治区自然科学基金资助项目200308020102

在线出版日期：2008-12-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1188-1194