丙型肝炎病毒基因分型及core蛋白区的分子演化分析

摘要：

目前有多种方法对丙型肝炎病毒进行基因分型,但尚无一个"金标准".为确定丙型肝炎病毒基因分型的最佳区域,从GenBank中筛选出15条对各成熟肽区域有注释,来源于不同国家地区的丙型肝炎病毒全基因组序列,分别对5'UTR区、core区、E1区、E2区及NS5B区建系统进化树.结果发现,以5'UTR区建树基因分型不完全正确,而以core区、E1区、E2区及NS5B区建树,基因分型均完全正确,但同一基因型间的核苷酸演化距离存在差异.计算5条1a型序列的core区、E1区、E2区、NS5B区的核营酸演化距离并和全基因组序列核苷酸演化距离比较,结果发现,NS5B蛋白区基因分型最能反映病毒株间的演化关系.同时分析各序列的core区的分子演化,为发明针对core区的新的PCR-RFLP基因分型方法提供新思路.

关键词：丙型肝炎病毒、基因型、分子演化、核心蛋白

所属期刊栏目：35

分类号：Q75;R37

在线出版日期：2008-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：964-968