基于序列保守性和蛋白质相互作用的真核蛋白质亚细胞定位预测

摘要：

蛋白质的亚细胞定位是进行蛋白质功能研究的重要信息.蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能.尝试了将保守序列及蛋白质相互作用数据的编码信息结合传统的氨基酸组成编码,采用支持向量机进行蛋白质亚细胞定位预测,在真核生物中5轮交叉验证精度达到91.8%,得到了显著的提高.

关键词：亚细胞定位、氨基酸组成、序列保守性、蛋白质相互作用、支持向量机

所属期刊栏目：35

分类号：Q6(生物物理学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划9732003CB715900;国家高技术研究发展计划8632006AA020403;国家自然科学基金30770498

在线出版日期：2008-07-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：531-535