芯片数据标准化方法比较研究

摘要：

在基因芯片实验中,基因表达水平之间的相关性在推断基因间相互关系时起到非常重要的作用.未经标准化处理的芯片数据基因之间往往都呈现出很强的相关性,这些高相关性一部分是由基因表达水平变化引起的,而另外一部分是由系统偏差引起的.对芯片数据进行标准化处理的目的之一是消除系统偏差引起的高相关性,同时保留由真正生物学原因引起的基因表达水平高相关性.虽然目前对标准化方法已经有了不少比较研究,但还较少有人研究标准化方法对基因之间相关系数的影响,以及哪种方法最有利于恢复基因之间的相关性结构.通过对基因表达水平数据的模拟,具体比较了几种常用标准化方法的效果,从而给出最有利于恢复基因之间相关性结构的那种标准化方法.

关键词：基因芯片、标准化、相关系数

所属期刊栏目：34

分类号：Q612(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金30400552;国家重点基础研究发展计划973计划2006CB503806;微软亚洲研究院开放项目

在线出版日期：2007-07-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：625-633