基于关联基因本体论注释的蛋白质相互作用预测

摘要：

细胞中的生理活动主要是通过蛋白质-蛋白质之间的相互作用来调控完成.详尽细致的蛋白质-蛋白质相互作用网络的解析对于理解细胞中复杂的调控、代谢和信号通路有重要的意义.近年来,关于新的蛋白质-蛋白质相互作用预测领域进展快速,这里,利用贝叶斯算法结合关联的GO(Gene Ontology),来预测蛋白质的相互作用.利用非冗余的蛋白质相互作用数据来观察GO对的特性,得到GO关联的概率.通过阳性的和阴性的标准对照数据证实这个新方法可以很好地区别这两类不同的数据,显示出较好的灵敏度和非常低的假阳性预测率.通过与已知的高通量的实验数据比较,这个方法具有灵敏度高、速度快的优点.而且,运用这个新方法可以提供一些新的关于细胞内蛋白质之间相互作用的信息,为进一步的实验提供理论依据.

关键词：蛋白质-蛋白质相互作用、关联的、基因本体论、贝叶斯(Bayesian)

所属期刊栏目：32

分类号：Q811.4(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金30171071

在线出版日期：2005-06-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：449-455