SSH法结合定量PCR技术研究双肌臀猪肌肉组织的差异表达基因

摘要：

利用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)成功地构建了双肌臀与非双肌臀大白猪肌肉组织差异表达的消减cDNA文库,获得有效克隆686个.对整个文库测序分析,共获得587条有效序列.利用BLAST在线软件与GenBank、GenBank EST和Tigr Porcine EST等数据库进行同源序列比较,发现其中有11个未知新序列,可能代表"双肌臀"大白猪肌肉组织特异表达的新基因.对文库中所包含的兰尼啶受体基因(RYR1)、钙依赖性蛋白激酶基因(CAMK2)、人类胰岛素生长因子结合蛋白-7基因(IGFBP7),以及695号、882号和480号3个新基因进行了实时荧光定量PCR检测,结果显示:RYR1、CAMK2及IGFBP7基因在双肌臀猪肌肉组织RNA池中的表达量,分别为对照的非双肌臀猪肌肉组织RNA池中表达量的1.87、1.90和1.85倍;695号、882号和480号3个新的ESTs在双肌臀猪肌肉组织RNA池中的表达量为非双肌臀猪肌肉组织RNA池中表达量的1.48、1.44和1.78倍.这提示我们,上述基因的上调表达很可能与猪双肌臀性状的发生有密切的关系,可以作为研究该性状的候选基因.

关键词：双肌臀大白猪、抑制性消减杂交、基因差异表达、荧光定量PCR

所属期刊栏目：32

分类号：Q7(分子生物学)

资助基金：科技部科研项目TG2000016104;国家重点基础研究发展计划973计划39725022

在线出版日期：2005-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：353-358