多样性指标用于基因中剪切位点的识别

摘要：

根据基因剪切位点处的碱基保守性特征,和附近位点的碱基组成和关联特征,应用多样性指标和二次判别分析,对几类模式生物的基因结构进行统一的分析和预测,能够较好地识别外显子和内含子及其边界.计算结果表明,对于4类物种,线虫(C.elegans),拟南芥(A.thaliana), 果蝇(D.melanogaster)和人类(human),核苷酸水平的识别精度为92.5%～97.1%,外显子水平的识别敏感性为83.7%～94.5%,特异性为87.8%～97.1%.预测能力优于GeneSplicer等剪切位点检测软件.

关键词：剪切位点、多样性增量、二次判别法、外显子、内含子

所属期刊栏目：31

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金90103030

在线出版日期：2004-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：77-82