蛋白质结构型的识别方法

摘要：

给出了α型、β型、α/β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律.提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别(分类)的方法.以蛋白质二级结构主序列三联体为参数,利用Mahalanobis距离方法对上述4种结构型的蛋白质进行识别,分类的总体准确率为81%;以二级结构主序列中六联体的频数构成蛋白质结构的多样性源,利用多样性增量极小化对上述4种结构型进行识别,分类的总体准确率为83%同时也给出了对紧结构域的识别途径.

关键词：蛋白质结构型、二级结构序列、多样性指标

所属期刊栏目：29

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金39960023,90103030

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：938-941