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10.13523/j.cb.20170207

拟南芥蛋白质丰度与基因翻译效率关联分析

引用
蛋白质的合成是一个复杂的过程,其中蛋白质丰度是衡量基因表达的一个最终指标,在生物体生命活动中具有重要作用的蛋白质通常都为高丰度蛋白质.通过对PaxDB网站拟南芥各组织器官蛋白质丰度的统计,并采用DAMBE和CodonW计算其对应基因的ITE和CAI值,最后用R语言分析蛋白质丰度与ITE的关系,并采用对数值替代原有的丰度值.结果表明,所使用的ITE较原有CAI的分析方法更有效,在拟南芥的基因中高表达基因在不同的组织中有相似的表达水平,拟南芥蛋白质丰度与ITE有很好的相关性,并且ITE值能更好地拟合拟南芥蛋白质丰度值的变化.

蛋白质丰度、基因表达、CAI、ITE、翻译延伸效率、相关分析、拟南芥

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2017-04-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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