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红花microRNAs靶基因的生物信息学预测

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miRNA是一类动、植物细胞中负责转录后调控的非编码RNA,植物的miRNA通常来源于具有茎环结构的单链RNA前体上,加工成熟后同ARGONAUTE转变成蛋白复合体结构,通过结合并沉默蛋白合成模板的方式关闭完整的基因表达网络.由于miRNA存在组织表达的特异性,且miRNA在植物中的表达高度保守.通过高通量测序获得的红花(Carthamus tinctorious L.)miRNA序列信息与红花转录EST数据库比对,通过靶基因预测筛选,对属于104个家族的173个红花miRNA进行预测,其中得到109个miRNAs对应调控的385个红花靶基因.并且通过Nr基因注释表明多数红花miRNA的靶基因编码包括调控细胞生长发育、信号转导及新陈代谢等相关的功能蛋白.

红花、靶基因预测、microRNA

32

Q789(基因工程(遗传工程))

国家"863"计划SQ2010AA1000691008;国家自然科学基金30971804

2013-01-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共6页

33-38

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中国生物工程杂志

1671-8135

11-4816/Q

32

2012,32(10)

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