唐鱼养殖种群与广州附近4个野生种群的遗传关系

摘要：

唐鱼(Tanichthys albonubes)是为数不多的几种原产中国的世界性观赏鱼类之一.自2003年以来,多个唐鱼野生种群相继被发现,其濒危状态和等级由野外灭绝降为极危.为研究唐鱼养殖种群与广州附近野生种群之间的遗传关系,本文分析了唐鱼3个代表性养殖种群和4个野生种群,共计186个样本的Cyt b基因、2个核基因(ENC1和RAG1)以及13个微卫星位点数据.基于K2P模型的遗传距离结果显示,唐鱼野生种群间的遗传距离在0.005-0.015之间,养殖种群间的遗传距离为0.001-0.009.系统发育分析表明,唐鱼养殖种群包含4个单倍型谱系分支,其中2个分别与广州附近2个野生种群聚在一起,另外2个分别独立成支.单倍型网络亲缘关系分析显示,清远种群只有1个单倍型且与芳村养殖种群共享,芳村养殖种群拥有最多的单倍型.基于微卫星数据的STRUCTURE分析表明,所有种群最佳分簇数为2,清远种群与养殖种群聚为一簇,良口和石门种群聚为另一簇.主成分分析结果显示,养殖种群高度重叠并能与野生种群分开,清远种群与养殖种群存在部分重叠.利用IMa3的基因流分析表明,存在清远种群至芳村养殖种群的单向基因流.综合本文结果,作者认为唐鱼养殖种群应起源于广州附近多个野生种群.清远种群来源于养殖种群中的芳村养殖种群.建议在未来唐鱼的保护策略中,应禁止不规范的放流活动并且禁止将不同野生种群补充至养殖种群,同时加强唐鱼养殖种群和野生种群的遗传资源管理和持续监测.

关键词：Tanichthys albonubes、线粒体基因、核基因、微卫星、基因流

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资助基金：国家自然科学基金;国家科技基础平台项目;中国-东盟海上合作基金;国家留学基金;广东省高校青年优秀科研人才国际培养计划;华南师范大学拔尖研究生联合培养项目

在线出版日期：2020-07-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：474-484