莲品种DNA指纹图谱的构建

摘要：

为了克服单纯依据形态特性鉴定品种的局限性,我们开展了莲品种DNA指纹图谱构建研究,旨在对其品种的快速准确鉴定及专利权保护等起一定作用.本研究以圆明园保存的72个莲品种为实验材料,用来自不同地点的1,409份野生莲(Nelumbo nucifera)和58份美洲黄莲(N.lutea)群体样本作遗传背景参照.从104对核微卫星引物(nSSR)中筛选出15对,从17对叶绿体微卫星(cpSSR)引物中筛选出2对,共17对引物作为72个莲品种DNA指纹鉴定的条码.15对nSSR引物共检测到94个等位基因(平均6.27个),其中11个属于美洲黄莲,65个属于野生莲,18个不能区分;多态信息含量(PIC)介于0.3899-0.8023之间(平均0.5748).2对cpSSR引物共检测到13个单倍型,其中9个属于野生莲,4个属于美洲黄莲.全部17对引物标记结果显示,共有19个品种含有美洲黄莲遗传组分,其中8个母系来源于美洲黄莲;有36个品种(涉及12对引物)具有至少1个特有基因型;最少8对引物组合可完全区分开68个品种.有2组共4个品种组内全部17对引物均不能区分.本研究通过核心引物组合法使68个莲品种获得特异性DNA指纹.推荐13对nSSR和2对cpSSR共15对引物作为莲品种鉴定的核心条码,并建议将形态特征与DNA指纹相结合作为莲品种的鉴定标准.

关键词：DNA指纹、微卫星、Nelumbo、品种鉴定、分子身份证

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资助基金：国家自然科学基金31270262、科技基础性工作专项2013FY112300、北京市海淀区科委项目K2012004S

在线出版日期：2016-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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