铁死亡相关的LncRNAs在甲状腺癌中的预后价值及预后风险模型构建

摘要：

目的:探讨铁死亡相关的长链非编码RNAs(LcRNAs)在甲状腺癌中的预后价值并构建预后风险模型.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下栽甲状腺癌的转录本数据和临床数据,铁死亡相关的基因数据集是从铁死亡数据库(http://www.zhounan.org/ferrdb/)下载的259个基因集.得到铁死亡相关LncRNAs,与患者临床信息合并后,通过单因素Cox回归分析和Kaplan-Meier生存分析两种方法得到与甲状腺癌预后相关的铁死亡LncRNAs,通过R的survival包构建COX模型以此来建立最佳预后风险模型并予以验证.结果:获得30个铁死亡相关的LncRNAs,多因素cox分析得到10个与甲状腺癌预后相关的铁死亡LncRNAs,包括AL136366.1、AL1622312、CRNDE、AC004918.3、LINC02471、AC092279.1、AC046143.1、LINC02454、DOCK9-DT、AC008063.1.Kaplan-Meier生存分析表明高风险组预后较差.单因素和多因素Cox分析表明风险评分可以作为独立预后因子.KEGG通路富集分析发现,差异基因可能与嘧啶代谢、核苷酸切除修复、NOTCH信号通路等通路有关.结论:通过生物信息学方法筛选出10个与甲状腺癌预后的铁死亡相关LncRNAs,并成功构建预后风险模型.

关键词：甲状腺癌;铁死亡;LncRNAs;生物信息学;预后;风险模型

所属期刊栏目：22

分类号：R736.1(肿瘤学)

资助基金：南京医科大学科技发展基金一般项目;江苏省自然科学基金青年基金项目

在线出版日期：2022-03-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：282-288