不同DNA聚合酶对运用ARTIC工作流的新型冠状病毒纳米孔测序的影响

摘要：

目的:为了验证不同高保真DNA聚合酶是否会对运用ARTIC工作流进行新型冠状病毒纳米孔测序产生影响.方法:使用英国Nanopore公司MinION测序仪对2份已获得全基因组序列的新冠肺炎确诊病例核酸样本分别采用KAPA HiFi HotStart ReadyMix,PrimeSTAR? GXL DNA Polymerase 和 NEBNext High-Fidelity 2X PCR Master Mix 进行 ARTIC 工作流的多重 PCR 扩增,对扩增产物进行测序,并对测序质量进行分析.结果:不同高保真DNA聚合酶在相同扩增条件下,扩增产物的质检结果和测序质量均不相同,NEBNext High-Fidelity 2X PCR Master Mix在覆盖度和测序深度上明显好于另外两种酶.结论:NEBNext High-Fidelity 2X PCR Master Mix在纳米孔新型冠状病毒ARTIC快速测序工作流中的应用效果较好.

关键词：新型冠状病毒;高保真DNA聚合酶;纳米孔测序;ARTIC工作流

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分类号：Q93-332;R-332;R373.1(微生物学)

资助基金：国家科技重大专项项目2018ZX10305410-004

在线出版日期：2021-09-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2401-2405