基于液相色谱-质谱技术的早期胃癌血清多肽组学研究

摘要：

目的:建立早期胃癌外周血清特征性多肽谱,分析其生物学特征,以探索一种特异且敏感的早期胃癌血清学诊断方法.方法:采集10例早期胃癌和10例正常对照血清,使用蛋白沉淀法去除高丰度血清蛋白质后,通过液相色谱-质谱联用技术重复三次进行多肽分离、离子化、质谱检测,将原始数据应用Label free方法中MaxQuant算法对肽段进行相对定量,分析两组差异多肽及差异多肽匹配蛋白.结果:EGC组和N组重复三次所得色谱图总体比较一致,多肽重复检出率分别为87.54％和85.67％.其中EGC组可重复检测到的Unique pepfide有65条,匹配对应31个蛋白;在EGC组和N组血清中显著差异的Unique peptide有22条,匹配对应11个蛋白.对血清显著差异多肽所匹配蛋白进行生物学分析,发现这些蛋白质多数位于细胞外,功能类别主要涉及分子水平的序列变换、信号肽、N-糖基化位点等,信号通路主要富集在凝血级联通路和补体级联通路.结论:早期胃癌血清特异性多肽谱图的建立可望成为胃癌早期诊断的血清学标志物,后续试验将进一步针对这些差异多肽进一步分析验证,筛选出早期胃癌标志性多肽,同时应用大样本进行验证,筛选出特异高效的早期胃癌血清标志物.

关键词：早期胃癌、血清、液相色谱-质谱联用、多肽组学

所属期刊栏目：18

分类号：R-33;R735.2(医学研究方法)

资助基金：上海市科学技术委员会基金项目134119a3100

在线出版日期：2018-08-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1616-1623,1668