基于SNP互作识别潜在冠心病致病基因

摘要：

目的:基于全基因组关联分析(Genome wide association study,GWAS)数据与生物信息学方法,识别冠心病潜在致病基因.方法:利用生物信息学方法和GWAS数据,对单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)进-疾病风险打分,依据特定距离阈值内的SNP-SNP互作关系,筛选出疾病相关SNP显著风险模块,识别潜在致病基因.结果:设定阈值20kb,经筛选获得279个SNP显著风险模块,映射到79个基因,文献验证率为71.01％.结论:基于SNP互作识别的潜在致病基因,能更加准确的分析冠心病的发生发展过程.

关键词：SNP、互作、模块、冠心病

所属期刊栏目：16

分类号：R541.4(心脏、血管（循环系）疾病)

资助基金：国家自然科学基金项目61272388;黑龙江省自然科学基金项目F201237;国家大学生创新创业训练项目201416226010

在线出版日期：2016-08-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：4156-4158