人Daintain基因5'调控区序列的生物信息学分析

摘要：

目的:探讨人Daintain基因5'调控区的序列特征.方法:利用在线软件BLAST、Neural Network Promoter Prediction、Promoter 2.0、Promoter SCAN、EMBOSS、CpG Island Searcher和TF SEARCH预测人Daintain基因启动子区域、CpG岛分布和转录因子结合位点.结果:人Daintain基因5'调控区存在1个CAAT盒.Daintain基因可能存在6个启动子位点,CpG岛可能位于216 bp区间(23～238 bp).评分85分以上时,该序列存在251个可能的转录因子结合位点;评分90分以上时,该序列存在70个可能的转录因子结合位点;评分95分以上时,该序列存在16个可能的转录因子结合位点;评分100分以上时,该序列存在7个可能的转录因子结合位点;这些结合的转录因子基本是与免疫细胞增殖或性别发生有关.结论:人Daintain基因5'调控区的生物信息学研究表明其转录受甲基化和多种转录因子的调控,为研究Daintain基因启动子的功能提供理论基础.

关键词：人Daintain基因、5’调控区、启动子、CpG岛、转录因子结合位点

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分类号：R34;Q756;Q811.4(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：国家自然科学基金项目81460558,81172511;海南医学院人才引进科研启动经费2013005

在线出版日期：2015-12-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：4178-4181