NanoString nCounter分析系统进行多基因表达计数的评价

摘要：

目的:NanoString nCounter是近年发展起来的进行基因表达谱检测的新平台,它利用分子条形码直接对基因表达进行多重计数.本实验通过对mRNA表达量的检测,分析nCounter系统进行基因表达计数的可靠性.方法:应用NanoString公司提供的CAE Kit试剂盒,通过杂交(mRNA样品与报告探针和捕获探针杂交)、纯化(清洗未结合探针)和计数(读取mRNA的条数)三个步骤,检测由人参考RNA和人脑RNA构成的4个样品中48个目的基因的mRNA表达量;对获得的未进行标准化的原始数据,应用Excel 2007软件进行线性分析,从再现性、稳定性、准确性方面对nCounter分析系统进行评估.结果:再现性分析所有R2均大于0.998,线性拟合良好;试剂盒中阳性控制所有R2均大于0.99,高于质控要求的0.95;样品H70B30和H30B70的预期表达量与实测值线性R2大于0.999,预期值与实测值一致性良好.结论:nCounter分析系统稳定性好,准确性高,检测mRNA表达可靠.

关键词：NanoString nCounter、多基因表达计数、评价

所属期刊栏目：15

分类号：R-331(医学研究方法)

资助基金：国家重点基础发展规划项目973项目2013CB530605

在线出版日期：2015-02-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：413-416