Chlorella sorokiniana rbcL基因的克隆与序列分析及其与18S rRNA基因在分类学上的比较

摘要：

Rubisco大亚基基因(rbcL)广泛用于系统学分析中,在本文中以Chlorella sorokiniana CS-01叶绿体基因组DNA为模板,PCR扩增rbcL全长编码区序列,序列分析表明:该片段全长1428 bp,其中包括1425 bp的编码区序列,编码475个氨基酸,经BLAST比对发现同源性最高的为Chlorella sp.IFRPD 1018,同源性达到99.2%.同时构建系统发育树,结果显示Chlorella sorokiniana CS-01与Chlorella sp.IFRPD 1018在同一分支中.18S rDNA序列分析表明:该片段全长1740 bp,经BLAST比对发现同源性最高的为Chlorella sorokiniana,同源性达到99.7%,构建系统发育树显示Chlorella sorokiniana CS-01与两株Chlorella sorokinia 在同一分支中,支持率达到100%.但是18S rDNA序列构建的系统发育树鉴定的主要分支很少,即使鉴定出分支,该分支的支持率也比较弱,而rbcL基因序列构建的系统发育树则分支清晰且支持率较高.可见18S rDNA序列比rbcL基因序列保守性更强,进化速度更慢,因此rbcL基因序列适合亲缘关系更近的微藻的系统研究.

关键词：小球藻、rbcL、克隆、序列分析

所属期刊栏目：10

分类号：Q75;Q78;Q939.9(分子遗传学)

资助基金：国家自然科学基金创新研究群体科学基金资助项目50621063

在线出版日期：2011-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：4601-4605