FZ6基因及其蛋白的生物信息学分析

摘要：

目的:对frizzled 6(FZ6)基因和Frizzled 6(Fz6)蛋白进行生物信息学分析,更多的了解该基因的相关信息.为进一步研究Wnt-Fz信号通路以及FZ基因与神经管发育缺陷相关性研究提供基础.方法:运用Internet上的数据库及程序,对FZ6基因结构、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点、Fz6蛋白的二级结构、蛋白相互作用网络以及Fz蛋白家族的多重序列比对进行生物信息学分析.结果:FZ6基因染色体定位于8q22.3-q23.1,基因全长33995bp,编码706个氨基酸;编码区存在8个SNPs位点,其中错义SNPs 4个;多序列比对结果显示lO个Fz蛋白家族成员分为4个亚类,Fz3和Fz6为同一类;Fz6蛋白有2个保守的结构域,蛋白序列羧基端缺少其他Fz蛋白普遍存在的S/T-X-V序列模式;其二级结构以α螺旋和随机卷曲为主.结论:通过对FZ6基因及其蛋白的生物信息学分析获得了其相应的生物学特征,为进一步研究奠定基础.

关键词：frizzled基因、生物信息学分析、Wnt-Fz信号通路

所属期刊栏目：10

分类号：Q75;R318.04(分子遗传学)

资助基金：天津市卫生局科技基金基金09KY14;天津医科大学科学研究基金2009ky41

在线出版日期：2010-09-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1052-1054