我国口岸瓜实蝇监测样本的SSR分子标记分析

摘要：

[目的]瓜实蝇是世界性检疫害虫,被列入我国口岸常年监测计划中.本研究以检疫性有害生物瓜实蝇为研究对象,利用不同地理种群瓜实蝇的转录组发现特异性的微卫星(simple sequence repeats,SSR)序列,分析我国口岸监测的瓜实蝇样本的遗传多样性.[方法]利用生物信息学方法,对4个不同地理来源的瓜实蝇转录组进行分析,发现了特异性的SSR序列,并设计特异性引物,选用我国11个省市的49个瓜实蝇监测样本进行测试及验证,使用NTsys和Popgene 32软件进行遗传多样性分析.[结果]筛选出15对多态性较好的引物,UPGMA聚类分析显示,新疆、四川和广西种群归为一支,浙江、广东、江苏种群归为一支,上海、云南、海南、天津种群归为一支,北京种群单独聚为一支.[结论]聚类分析结果显示,11个不同省市的瓜实蝇监测样本间基因分化系数为0.6712,表明不同口岸的瓜实蝇监测样本间的遗传分化较大,可能具有不同的来源地,可为进一步开发监测样本溯源技术提供理论依据.

关键词：瓜实蝇、转录组、微卫星标记、遗传多样性

所属期刊栏目：28

资助基金：国家重点研发计划项目;上海出入境检验检疫局科技项目

在线出版日期：2020-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：259-268